岛际交通码头建设加快。现拥有码头总数75个，基本解决了2000人以上岛屿交通码头建设；建有汽车轮渡码头9对，其中通往大陆的5对；乡镇渡口83个，下步计划建设1000人左右岛屿交通码头，做到每个岛屿至少拥有一个专业交通码头，主要经济大岛分别建造客运交通码头和货运码头，实现客货分流，到2010年，设想实现连岛工程，岛屿交通逐步做到客运快速、货运畅通、列岛相连、群岛成片，使舟山真正成为开发海洋的重要基地。现正着手建设定海老港改造、普陀山客运泊位改造、朱家尖蜈蚣峙客运港区改造等重点工程，确保全市交通基础设施有进一步改善。
运输装备发展迅速，运力档次和运输效率明显提高。陆上客运基本实现了公交中巴化；全市各经济大岛投放了“桑塔纳”等出租车1000余辆。目前，全市拥有客运车辆2028辆/19544座，货运车辆1952辆/6010吨，市内客运班车73班次；与大陆相联的客运航线达29条，货运航线北起丹东，南抵海南、香港、新加坡，东至日本；岛间乡镇渡船向钢质化“三防”渡船发展，现有渡船138艘。98个住人岛屿岛岛通渡。2000年旅客周转量14.03亿人公里，货物周转量91.85亿吨公里，从而基本缓解了海岛居民“乘车难、乘船难”困境，有力地促进了舟山经济发展。
目前，舟山正开展“海上提速”工程，现主要经济大岛与市中心基本形成2小时经济速度圈。客船向豪华、舒适和快速化发展，货船向大型化、钢质化、特种化发展，努力在舟山形成一个以本岛为中心，用跨海大桥和车客渡沟通大陆、辐射诸岛，道路畅通、海运发达、客运便捷的综合、立体型陆岛交通运输体系，促进舟山经济发展。 | 